Pracovníci laboratoří Farmakogenomiky a Nádorové léčby a regenerace tkáně jsou spoluautory experimentálního článku v časopisu Microbiome (D1 v oboru Mikrobiologie), ve kterém popisují výsledky osmileté spolupráce s týmem prof. Juliana Marchesi z Imperial College v Londýně a dalšími kolegy ze špičkových laboratoří ve Velké Británii a Irsku.
Pracovníkům Laboratoře farmakogenomiky BC a Ústavu biologie LFP vychází na začátku nového roku bioinformatický článek v časopise Frontiers in Genetics (Q1 v kategorii Genetics & Heredity). Práce pojatá jako pilotní studie blíže charakterizuje umístění nejdelšího intronu v rámci sekvence lidských protein-kódujících genů. Je zpřesněna dosud známá obecná informace, že nejdelším intronem bývá u eukaryotních organismů první intron, případně některý z intronů na začátku genu. Dle naší práce je takových genů v lidském genomu přibližně 60 %. Práce se dále věnuje právě genům, u kterých je nejdelší intron lokalizován až ve druhé či třetí třetině genu. Pomocí gene set enrichment analýzy se podařilo prokázat, že u některých genů existuje významný vztah mezi umístěním nejdelšího intronu a jejich biologickou funkcí. Z genů významných pro studium karcinogeneze patří mezi takové geny např. geny pro DNA repair. Práce naznačuje i možný vliv pozice nejdelšího intronu na tkáňově specifickou hladinu genové exprese. Tomuto nově formulovanému tématu se laboratoř bude dále věnovat a hledat i jeho konkrétnější napojení na další témata klinického výzkumu probíhajícího v laboratoři se směřováním k precisní onkologii.
Článek je volně k dispozici dalším výzkumníkům na adrese: Frontiers | The position of the longest intron is related to biological functions in some human genes (frontiersin.org)
Mgr. Petr Holý, doktorand pracující v Laboratoři farmakogenomiky Biomedicínského centra Lékařské fakulty v Plzni, Univerzity Karlovy, získal první cenu za poster v postgraduální kategorii na Studentské vědecké konferenci 3. lékařské fakulty UK konané v Praze 24. května 2022.
Biomedical Center, Faculty of Medicine in Pilsen, Charles University, is seeking students for the following Ph.D. study topics in the doctoral study programme of Experimental Surgery:
Rádi přivítáme studenty zajímající se o molekulární biologii, nádorovou genetiku a bioinformatiku. Studium je vhodné jak pro absolventy biologických, tak informatických pregraduálních oborů.
Bližší informace podá Pavel Dvorak, Ph.D., Ústav biologie, Alej Svobody 76, 323 00 Plzeň, tel. +420 377 593 263, e-mail: Tato e-mailová adresa je chráněna před spamboty. Pro její zobrazení musíte mít povolen Javascript..
V prostředí krásné šumavské přírody proběhlo ve dnech od pátku 22. do neděle 24. 3. 2019 jubilejní desáté setkání s názvem Přínos farmakogenomiky v diagnostice a léčbě generalizovaného kolorektálního karcinomu X., na němž se sešly spolupracující vědecké týmy věnující se otázkám nádorové léčby, především molekulární onkologii.
